Das ist eine vielbesprochene und heiß diskutierte Frage. Es gibt da mehrere Theorien: Tom sei ein Maiar, oder gar ein Valar, Tom sei Eru höchstpersönlich u.v.m.
Er wird beschrieben als etwas größer und dicklicher als die Hobbits, aber nicht groß genug, um ein Mensch zu sein. Er trägt einen alten, schäbigen Hut mit einer langen, blauen Feder, einen blauen Mantel und hohe, gelbe Stiefel. Sein Gesicht ist "rot wie ein reifer Apfel, aber zerknittert von hundert Lachfalten", er hat blaue Augen und einen langen braunen Bart.
Auch Frodo hat in "Der Herr der Ringe - Die Gefährten" diese Frage an Goldbeere, Tom Bombadils Gattin, gestellt:
"'Schöne Frau', sagte Frodo nach einer Weile. 'Sagt mir, wenn meine Frage nicht töricht klingt, wer ist Tom Bombadil?'
'Er ist', antwortete Goldbeere, hielt in ihren raschen Bewegungen inne und lächelte."
Eine konkrete Antwort auf die Frage nach Bombadils Wesen und Herkunft innerhalb der mittelirdischen Kosmologie gibt es aber nicht und wird es wohl auch nie geben. Tolkien sagt in einem Brief über Tom Bombadil: "Ein paar Rätsel muss es immer geben, sogar in einem mythischen Zeitalter. Tom Bombadil ist eines."
Dong - long! Dongelong! Läute laute lillo!
Wenn - wann, Weidenmann! Bimmel bammel billo!
Tom Bom! Toller Tom! Tom Bombadillo!